Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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SCARB2Q14108 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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SCARB2Q14108 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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SCARB2Q14108 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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SCARB2Q14108 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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SCARB2Q14108 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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SCARB2Q14108 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCARB2Q14108 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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