Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CBFBQ13951 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.9 ms