Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
GTF2H3Q13889 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
GTF2H3Q13889 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms