Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHROOM2Q13796 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
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SHROOM2Q13796 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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SHROOM2Q13796 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SHROOM2Q13796 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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SHROOM2Q13796 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SHROOM2Q13796 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SHROOM2Q13796 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SHROOM2Q13796 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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SHROOM2Q13796 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHROOM2Q13796 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHROOM2Q13796 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SHROOM2Q13796 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
SHROOM2Q13796 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHROOM2Q13796 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHROOM2Q13796 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SHROOM2Q13796 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
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SHROOM2Q13796 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SHROOM2Q13796 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SHROOM2Q13796 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHROOM2Q13796 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHROOM2Q13796 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHROOM2Q13796 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SHROOM2Q13796 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SHROOM2Q13796 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
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