Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAF1Q13077 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms