Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
GRIK2Q13002 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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