Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SOBPA7XYQ1 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SOBPA7XYQ1 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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