Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CIPCQ9C0C6 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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