Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 NOTCH2-207ENST00000602566 5046 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 NOLC1-209ENST00000605788 3932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIM66-201ENST00000299550 9753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNAH11-202ENST00000409508 14167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 WDR44-203ENST00000371825 4029 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 NFIB-205ENST00000380959 8198 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA71D-201ENST00000363484 134 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGLC6-201ENST00000410078 317 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL031848.1-201ENST00000419034 351 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009988.1-201ENST00000434988 310 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL022721.1-201ENST00000436521 505 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL563P-201ENST00000481233 298 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL241P-201ENST00000482973 236 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008496.1-201ENST00000509131 295 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGHVIII-82-201ENST00000522058 250 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 STH-201ENST00000537309 445 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01397-201ENST00000554808 579 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNM1P34-202ENST00000567850 315 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC068014.1-201ENST00000576836 413 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR3689C-201ENST00000581239 72 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC018521.6-201ENST00000584276 335 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 Metazoa_SRP.124-201ENST00000610352 345 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL820P-201ENST00000616437 299 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 COPB1-202ENST00000439561 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADAMTS3-201ENST00000286657 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNA1D-202ENST00000350061 7636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANKRD6-218ENST00000522441 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 CALML4-203ENST00000395465 4155 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 LIG4-204ENST00000611712 4180 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 HIVEP3-202ENST00000372584 12319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 HKR1-223ENST00000591471 3472 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABCC5-205ENST00000427120 4697 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 SP4-201ENST00000222584 6126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 F13A1-201ENST00000264870 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF844-201ENST00000439326 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 STK32B-207ENST00000512636 3272 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 HEATR6-212ENST00000613428 3287 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007126.1-201ENST00000508202 4781 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 NBPF12-202ENST00000579935 5035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRICKLE2-AS1-201ENST00000482609 6505 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 NEDD4L-214ENST00000586263 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 MBP-206ENST00000397863 4800 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 LCLAT1-201ENST00000309052 5060 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPIP5K2-202ENST00000358359 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAP7D3-203ENST00000370661 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM193A-204ENST00000505311 4110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRRG1-208ENST00000542554 4600 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATXN7L1-202ENST00000419735 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 GNG12-201ENST00000370982 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 PALM2-AKAP2-201ENST00000302798 4718 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 COLGALT2-203ENST00000367521 4723 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAGEC1-201ENST00000285879 4270 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 HAUS6-201ENST00000380496 3756 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 POGZ-205ENST00000409503 4813 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 EXOC5-211ENST00000621441 10589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 METTL14-201ENST00000388822 6669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 C9orf131-205ENST00000421362 3259 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM114A1-201ENST00000358869 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.5 ms