Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms