Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TPRNQ4KMQ1 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TPRNQ4KMQ1 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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