Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDO1Q16878 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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