Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms