Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SKIV2LQ15477 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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