Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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NECTIN1Q15223 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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NECTIN1Q15223 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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NECTIN1Q15223 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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NECTIN1Q15223 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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NECTIN1Q15223 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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