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| BRD3 | Q15059 | HULC.1-201 | ENST00000612720 | 240 nt | BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | uc_338.11-201 | ENST00000619132 | 160 nt | BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
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| BRD3 | Q15059 | ZNF682-207 | ENST00000595736 | 1710 nt | TSL 2 BASIC | 3.61 | □□□□□ -1.83 | | |
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| BRD3 | Q15059 | GMFB-208 | ENST00000554908 | 6721 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC006130.2-201 | ENST00000586202 | 326 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AL158209.2-201 | ENST00000619266 | 216 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC073534.2-201 | ENST00000620377 | 381 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR13G1-202 | ENST00000642119 | 2568 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
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| BRD3 | Q15059 | HERC5-203 | ENST00000508159 | 2243 nt | TSL 2 BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC093831.2-201 | ENST00000624393 | 3427 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC032011.1-201 | ENST00000611703 | 1549 nt | BASIC | 3.6 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | FIGNL1-203 | ENST00000419119 | 3700 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | CREBRF-201 | ENST00000296953 | 7778 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | DOCK7-202 | ENST00000340370 | 6731 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | ATP2B1-201 | ENST00000261173 | 6777 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | GABRG2-215 | ENST00000639213 | 9960 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR4G2P-201 | ENST00000328113 | 903 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-371P-201 | ENST00000364283 | 108 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNA5SP51-201 | ENST00000364750 | 119 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-898P-201 | ENST00000365627 | 104 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-1179P-201 | ENST00000384667 | 107 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6ATAC-201 | ENST00000408749 | 126 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU4-46P-201 | ENST00000410818 | 138 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | Y_RNA.623-201 | ENST00000411128 | 95 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC004870.3-202 | ENST00000412996 | 432 nt | TSL 3 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL365258.1-201 | ENST00000440885 | 247 nt | TSL 3 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU7-63P-201 | ENST00000459054 | 62 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPL27AP5-201 | ENST00000469428 | 449 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC092436.1-201 | ENST00000506450 | 503 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | SEM1P1-201 | ENST00000506694 | 209 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC008716.1-201 | ENST00000511084 | 513 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC108727.1-201 | ENST00000513802 | 393 nt | TSL 2 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORD19.2-201 | ENST00000516978 | 73 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP003469.3-201 | ENST00000518090 | 473 nt | TSL 3 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC02300-201 | ENST00000549742 | 665 nt | TSL 4 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC087463.1-201 | ENST00000568541 | 556 nt | TSL 2 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP005120.1-201 | ENST00000579321 | 352 nt | TSL 3 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC022960.1-201 | ENST00000582269 | 348 nt | TSL 3 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC008752.3-201 | ENST00000588113 | 712 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC005261.5-201 | ENST00000596280 | 355 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC00907-211 | ENST00000601948 | 795 nt | TSL 5 BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |