Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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BRD3Q15059 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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BRD3Q15059 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
BRD3Q15059 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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