Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SHPRHQ149N8 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SHPRHQ149N8 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
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