Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms