Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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COL9A3Q14050 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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