Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SMAD4Q13485 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
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