Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
AP3B2Q13367 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms