Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
NME3Q13232 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NME3Q13232 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NME3Q13232 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms