Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXC1Q12948 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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FOXC1Q12948 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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FOXC1Q12948 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FOXC1Q12948 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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