Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
HOXD10P28358 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms