Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ERVH48-1M5A8F1 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms