Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PSDA5PKW4 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms