Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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