Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SNX29Q8TEQ0 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SNX29Q8TEQ0 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165 ms