Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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TMIEQ8NEW7 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMIEQ8NEW7 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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TMIEQ8NEW7 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMIEQ8NEW7 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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TMIEQ8NEW7 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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TMIEQ8NEW7 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TMIEQ8NEW7 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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