Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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PTPRNQ16849 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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PTPRNQ16849 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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PTPRNQ16849 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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PTPRNQ16849 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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PTPRNQ16849 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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PTPRNQ16849 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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PTPRNQ16849 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRNQ16849 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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