Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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TNXAQ16473 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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TNXAQ16473 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
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TNXAQ16473 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
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TNXAQ16473 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
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TNXAQ16473 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
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TNXAQ16473 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
TNXAQ16473 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
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