Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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SIX1Q15475 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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SIX1Q15475 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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SIX1Q15475 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SIX1Q15475 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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