Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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CNN3Q15417 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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CNN3Q15417 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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CNN3Q15417 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CNN3Q15417 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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