Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LAPTM4AQ15012 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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