Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMC1AQ14683 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMC1AQ14683 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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