Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SEMA3FQ13275 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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SEMA3FQ13275 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SEMA3FQ13275 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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