Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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ERCC8Q13216 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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ERCC8Q13216 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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ERCC8Q13216 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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ERCC8Q13216 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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ERCC8Q13216 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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ERCC8Q13216 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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ERCC8Q13216 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ERCC8Q13216 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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