Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
CBX3Q13185 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CBX3Q13185 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CBX3Q13185 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CBX3Q13185 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CBX3Q13185 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CBX3Q13185 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CBX3Q13185 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CBX3Q13185 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CBX3Q13185 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CBX3Q13185 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CBX3Q13185 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CBX3Q13185 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CBX3Q13185 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CBX3Q13185 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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