Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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TRAF1Q13077 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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TRAF1Q13077 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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TRAF1Q13077 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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TRAF1Q13077 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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TRAF1Q13077 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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TRAF1Q13077 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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TRAF1Q13077 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TRAF1Q13077 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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