Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
NFX1Q12986 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFX1Q12986 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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