Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTP4A2Q12974 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTP4A2Q12974 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTP4A2Q12974 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTP4A2Q12974 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTP4A2Q12974 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTP4A2Q12974 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTP4A2Q12974 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTP4A2Q12974 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTP4A2Q12974 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTP4A2Q12974 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTP4A2Q12974 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTP4A2Q12974 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTP4A2Q12974 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTP4A2Q12974 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTP4A2Q12974 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTP4A2Q12974 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTP4A2Q12974 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTP4A2Q12974 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTP4A2Q12974 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTP4A2Q12974 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTP4A2Q12974 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTP4A2Q12974 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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PTP4A2Q12974 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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PTP4A2Q12974 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTP4A2Q12974 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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