Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CPSF1Q10570 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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