Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRHP20396 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRHP20396 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRHP20396 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRHP20396 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRHP20396 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRHP20396 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRHP20396 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRHP20396 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRHP20396 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRHP20396 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRHP20396 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRHP20396 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRHP20396 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRHP20396 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRHP20396 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRHP20396 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRHP20396 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRHP20396 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
TRHP20396 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRHP20396 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TRHP20396 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRHP20396 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRHP20396 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRHP20396 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRHP20396 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRHP20396 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRHP20396 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRHP20396 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRHP20396 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRHP20396 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRHP20396 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRHP20396 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRHP20396 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRHP20396 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRHP20396 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRHP20396 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRHP20396 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRHP20396 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRHP20396 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRHP20396 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TRHP20396 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRHP20396 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRHP20396 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRHP20396 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRHP20396 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TRHP20396 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRHP20396 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRHP20396 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRHP20396 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRHP20396 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRHP20396 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRHP20396 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRHP20396 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRHP20396 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRHP20396 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRHP20396 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRHP20396 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRHP20396 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRHP20396 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRHP20396 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRHP20396 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRHP20396 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRHP20396 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRHP20396 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRHP20396 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRHP20396 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TRHP20396 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
TRHP20396 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
TRHP20396 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TRHP20396 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TRHP20396 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
TRHP20396 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRHP20396 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRHP20396 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRHP20396 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRHP20396 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRHP20396 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRHP20396 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRHP20396 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRHP20396 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRHP20396 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRHP20396 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRHP20396 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRHP20396 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRHP20396 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRHP20396 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
TRHP20396 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRHP20396 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRHP20396 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TRHP20396 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TRHP20396 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms