Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
HOXD8P13378 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
HOXD8P13378 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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