Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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SPG7Q9UQ90 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SPG7Q9UQ90 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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