Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTF1Q16619 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms