Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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