Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
E2F4Q16254 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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