Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
ZFHX3Q15911 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ZFHX3Q15911 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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