Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC3Q15034 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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